簡要描述:SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態(tài),是由于單個核苷酸改變而導(dǎo)致的核酸序列多態(tài)。一般來說,SNP在人基因組中的發(fā)生頻率比較高,大約平均每1000個堿基中就有一個多態(tài)位點,是繼微衛(wèi)星之后的第三代遺傳標(biāo)記。SNP廣泛用于群體遺傳學(xué)研究(如生物的起源、進化及遷移等方面)和疾病相關(guān)基因的研究,在藥物基因?qū)W、診斷學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中起重要作用。
SNP(single nucleotide polymorphism)原理
SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態(tài),是由于單個核苷酸改變而導(dǎo)致的核酸序列多態(tài)。一般來說,一個SNP位點只有兩種等位基因,因此又叫雙等位基因。SNP在人基因組中的發(fā)生頻率比較高,大約平均每1000個堿基中就有一個多態(tài)位點,是繼微衛(wèi)星之后的第三代遺傳標(biāo)記。有些SNP位點還會影響基因的功能,從而導(dǎo)致生物性狀改變甚至致病。SNP廣泛用于群體遺傳學(xué)研究(如生物的起源、進化及遷移等方面,將逐漸取代微衛(wèi)星而成為新一代的分子生物學(xué)標(biāo)記)和疾病相關(guān)基因的研究,在藥物基因組學(xué)、診斷學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中起重要作用。
Multiplex SNaPshot SNP分型法
SNaPshot SNP分型法
是基于熒光標(biāo)記單堿基延伸原理的分型技術(shù),也稱小測序,主要針對中等通量的SNP分型項目。在一個含有測序酶、四種熒光標(biāo)記ddNTP、緊臨多態(tài)位點5’-端的不同長度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中,引物延伸一個堿基即終止,經(jīng)ABI測序儀檢測后,根據(jù)峰的移動位置確定該延伸產(chǎn)物對應(yīng)的SNP位點,根據(jù)峰的顏色可得知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型。對于PCR產(chǎn)物模板可通過多重PCR反應(yīng)體系來獲得。通常用于10-30個SNP位點分析。
SNaPshot SNP分型法服務(wù)流程
1. 客戶提供:
1).已純化基因組DNA,并填寫詳細基因組DNA量,濃度及純度
2).或提供新鮮的組織,血液,細胞樣本;且盡量多的材料
3).提供已知的基因序列或物種基因序列號;盡可能詳細的背景資料。
2.設(shè)計PCR 擴增含SNPs 位點的一段DNA序列。
3.對PCR 產(chǎn)物進行純化(去除引物和dNTP)。
4.引物延伸。
5.延伸產(chǎn)物測序。
6.提供:峰圖文件(abl.格式),序列文件(seq.格式);正式的數(shù)據(jù)分析報告。
樣本運輸:
客戶根據(jù)溫度,所在區(qū)域及樣本類型的差異,以加冰袋或干冰運輸,并保證樣本的密封性和完整性,以免造成不必要的污染和損耗。