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細胞系的錯誤鑒定該如何解決

  • 發(fā)布日期:2019-03-12      瀏覽次數(shù):1277
    •   細胞系對于生物醫(yī)學(xué)研究是非常有價值的工具。然而,它們作為正常或患病組織模型的有效性有賴于它們真的是研究人員所認為的組織類型和物種。不幸的是,據(jù)估計常用的細胞系中有14%~16%是被錯誤鑒別的。
        錯誤鑒別通常源于交叉污染(一種培養(yǎng)物被在同一實驗室中培養(yǎng)的另一種細胞系接替),也可能源于細胞培養(yǎng)中的錯誤操作。*,迄今為止建立的個人類癌細胞系HeLa細胞具有頑強的生命力,它們甚至可以存活在氣溶膠液滴中并以此方式污染其它細胞。由于HeLa細胞生長得特別快,它們終會在數(shù)量上超過其它細胞。研究發(fā)現(xiàn)被錯誤鑒別的細胞系中有30%~50%是HeLa衍生物[2,3]。對于大多數(shù)錯誤鑒別的細胞系來說,再也找不到真實的儲備了。
        盡管從20世紀60年代以來人們已經(jīng)意識到了細胞系錯誤鑒別的問題,但這個問題仍然普遍存在。例如,在1968年HEp-2被證明是HeLa(宮頸癌細胞)衍生物,但每年仍有研究人員將其作為喉癌細胞系研究并發(fā)表論文[1]。在很長一段時間里,期刊和資助機構(gòu)都沒有適當?shù)恼咭罂茖W(xué)家們對他們使用的細胞系進行鑒定。在過去的十年中情況有所轉(zhuǎn)變,現(xiàn)在越來越多期刊要求或鼓勵作者進行細胞系的鑒定[1,4],包括BioMedCentral的期刊、《International Journalof Cancer》、Nature出版集團的期刊等等。由于這類期刊數(shù)量不斷增加且不同期刊之間要求各異,因此在提交論文前檢查特定期刊的指南非常重要。例如,除了細胞系鑒定的基本要求外,《Journal of Hepatology》還聲明它將不再考慮使用一些已知被錯誤鑒別的細胞系(BEL7402、SMMC7721、MHCC97L等等)。美國國立衛(wèi)生研究院是將細胞系鑒定作為資助條件的資助機構(gòu)之一。
        短串聯(lián)重復(fù)序列(shorttandem repeat)(STR)分析法是期刊接受的人類細胞系鑒定方法,這是一種用于法醫(yī)學(xué)的DNA指紋技術(shù)。它是一種基于PCR的技術(shù),該方法同時測試大量多態(tài)微衛(wèi)星位點。STR分析可以將細胞系匹配到供體(如果供體的STR圖譜是已知的話)或已知STR圖譜的細胞系。然而,如果特意從同一供體上建立了兩種以上細胞系,那么這兩種細胞系不能通過STR分析來區(qū)分。由于細胞傳代的遺傳漂變,所培養(yǎng)的細胞的STR圖譜可能不會與供體100%匹配。目前的標準是用≥80%的匹配來確認細胞系的身份[5]。
        有關(guān)這一問題以及使用細胞系的推薦做法的更多信息,請查看細胞系認證委員會(ICLAC)的網(wǎng)站。ICLAC提供當前已知被錯誤鑒別的細胞系的索引,該索引現(xiàn)在列有488種細胞系。你還可以找到人類細胞系STR圖譜數(shù)據(jù)庫的鏈接以及關(guān)于此問題的許多其它的出版物和網(wǎng)址。